Visual Genomics - RS

v1.1.0 转录组分析软件

• 第一步：安装软件主体

  下载VGenomics_RS_V1.1.0x64.setup.exe，安装，点击这里查看安装说明！

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• 第二步：安装KO数据文件（KEGG功能注释）

  下载database.zip，并在软件安装根目录进行解压，点击这里查看配置说明！

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按上述两个步骤，完成VG转录组软件的完整安装（推荐）。如果不需要KEGG功能注释，可以不执行步骤二。

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下载，申请15天试用！关注 "VG生信软件" 公众号，获取激活码，額外增加45天 试用期限！ 点击这里了解详情！

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测试数据

测试数据ref-based_test_rawdata.zip，相比软件自带测试数据，数据量相对更大一些。 点击这里查看测试数据详细信息！

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• 功能全面：分析内容一网打尽!
• 权威度高：分析模块均源于公开发表的文献中，广受认可的算法和开源程序!
• 简单易上手：可视化操作，零基础、无需命令行和编程技能!
• 快速、高效：一键化完成分析，一键化导出网页结果!
• 个性化操作：个性化修改样品名、分组信息、个性化编辑数据和图片!
• 配置要求低：普通电脑配置（8G，2核），即可运行!

快速开始

• 第一步：公共数据库获取转录组分析所需相关文件操作说明文档
• 第二步：比对和定量流程说明文档

软件运行配置要求

• 64位Windows操作系统：Windows 7、Windows 8、Windows 10。
• 最低8G内存、2核心CPU电脑；推荐16G内存，4核心CPU电脑。

快速导航

• 安装和试用
• 教学视频
• 模块帮助文档
• 基本操作说明
• FAQ
• 数据管理和分析系统
• 关注公众号活动

更新日志

• 增加数据预处理环节，与Ensembl基因组数据库网站实现无缝对接。 可以直接下载Ensembl 网站上的参考序列、注释信息等数据进行转录组分析， 点此查看具体操作步骤说明（重点）！
• 增加基于Diamond的KEGG功能注释，需要下载相应的KO数据库， 点此进行下载配置！
• 优化所有定量分析流程，统一输出Count矩阵、FPKM矩阵、TPM矩阵。
• 增加Kalliso（alignment-free）定量功能，能够极大地提升定量分析速度，建议使用。
• 增加T检验、秩和检验、方差分析等单一变量统计分析模块。
• 增加共表达网络分析、随机森林、SVM支持向量机、logistic回归、ROC曲线等多元统计分析模块。
• 大量分析模块功能和帮助文档优化。
• 兼容性优化，BUG修复，提升软件运行健壮性。